Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP6V0D1P61421 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP6V0D1P61421 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V0D1P61421 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms