Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPS1P60891 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPS1P60891 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPS1P60891 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPS1P60891 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPS1P60891 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPS1P60891 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPS1P60891 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPS1P60891 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPS1P60891 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPS1P60891 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPS1P60891 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPS1P60891 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPS1P60891 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPS1P60891 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPS1P60891 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPS1P60891 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPS1P60891 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms