Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS3P57727 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMPRSS3P57727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMPRSS3P57727 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms