Protein–RNA interactions for Protein: P54868

HMGCS2, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS2P54868 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGCS2P54868 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMGCS2P54868 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMGCS2P54868 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMGCS2P54868 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGCS2P54868 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGCS2P54868 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGCS2P54868 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGCS2P54868 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGCS2P54868 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGCS2P54868 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGCS2P54868 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGCS2P54868 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HMGCS2P54868 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HMGCS2P54868 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HMGCS2P54868 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGCS2P54868 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGCS2P54868 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGCS2P54868 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGCS2P54868 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGCS2P54868 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HMGCS2P54868 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGCS2P54868 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGCS2P54868 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HMGCS2P54868 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGCS2P54868 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms