Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A3P53794 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A3P53794 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A3P53794 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms