Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFIP2P53365 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms