Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC42.82■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SMARCA2P51531 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
SMARCA2P51531 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
SMARCA2P51531 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SMARCA2P51531 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms