Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM25P49756 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM25P49756 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM25P49756 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM25P49756 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM25P49756 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM25P49756 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM25P49756 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM25P49756 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM25P49756 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM25P49756 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM25P49756 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM25P49756 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM25P49756 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM25P49756 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM25P49756 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM25P49756 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM25P49756 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM25P49756 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM25P49756 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM25P49756 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM25P49756 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM25P49756 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM25P49756 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM25P49756 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM25P49756 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM25P49756 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM25P49756 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM25P49756 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM25P49756 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM25P49756 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM25P49756 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM25P49756 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBM25P49756 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM25P49756 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RBM25P49756 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM25P49756 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM25P49756 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM25P49756 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM25P49756 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM25P49756 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM25P49756 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM25P49756 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM25P49756 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM25P49756 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM25P49756 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM25P49756 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM25P49756 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM25P49756 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM25P49756 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM25P49756 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RBM25P49756 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM25P49756 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM25P49756 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM25P49756 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM25P49756 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM25P49756 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM25P49756 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM25P49756 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM25P49756 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM25P49756 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM25P49756 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM25P49756 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM25P49756 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM25P49756 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM25P49756 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM25P49756 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM25P49756 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM25P49756 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM25P49756 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM25P49756 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM25P49756 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM25P49756 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM25P49756 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM25P49756 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM25P49756 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM25P49756 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM25P49756 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM25P49756 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms