Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POU3F4P49335 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POU3F4P49335 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU3F4P49335 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms