Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A11P48066 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A11P48066 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A11P48066 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A11P48066 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A11P48066 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A11P48066 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms