Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NF2P35240 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NF2P35240 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NF2P35240 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NF2P35240 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NF2P35240 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NF2P35240 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NF2P35240 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NF2P35240 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NF2P35240 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NF2P35240 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NF2P35240 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NF2P35240 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NF2P35240 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NF2P35240 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NF2P35240 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NF2P35240 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NF2P35240 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NF2P35240 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NF2P35240 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NF2P35240 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NF2P35240 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NF2P35240 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NF2P35240 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NF2P35240 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NF2P35240 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NF2P35240 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NF2P35240 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NF2P35240 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NF2P35240 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NF2P35240 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NF2P35240 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NF2P35240 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NF2P35240 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NF2P35240 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NF2P35240 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NF2P35240 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NF2P35240 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NF2P35240 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NF2P35240 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NF2P35240 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NF2P35240 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NF2P35240 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NF2P35240 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NF2P35240 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NF2P35240 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NF2P35240 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NF2P35240 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NF2P35240 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NF2P35240 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NF2P35240 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NF2P35240 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NF2P35240 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NF2P35240 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NF2P35240 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NF2P35240 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NF2P35240 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NF2P35240 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NF2P35240 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NF2P35240 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NF2P35240 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NF2P35240 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NF2P35240 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NF2P35240 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NF2P35240 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NF2P35240 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NF2P35240 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms