Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA3P32297 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms