Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UQCRC1P31930 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UQCRC1P31930 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UQCRC1P31930 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms