Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHATP28329 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHATP28329 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHATP28329 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHATP28329 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHATP28329 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHATP28329 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHATP28329 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHATP28329 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHATP28329 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHATP28329 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHATP28329 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHATP28329 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHATP28329 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHATP28329 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHATP28329 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHATP28329 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHATP28329 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHATP28329 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHATP28329 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHATP28329 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHATP28329 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHATP28329 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHATP28329 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHATP28329 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHATP28329 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHATP28329 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHATP28329 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHATP28329 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHATP28329 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHATP28329 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHATP28329 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHATP28329 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHATP28329 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHATP28329 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms