Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A2P23975 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A2P23975 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms