Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 GGH-202ENST00000518113 703 ntTSL 34.98□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MYH10-207ENST00000469865 504 ntTSL 23.25□□□□□ -1.893e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TMBIM6-220ENST00000549966 538 ntTSL 57.92□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 39.1
RPS3P23396 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 39.1
RPS3P23396 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 39.1
RPS3P23396 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 39.1
RPS3P23396 BUD31-208ENST00000473447 480 ntTSL 212.03□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 39.1
RPS3P23396 BUD31-203ENST00000427499 889 ntTSL 311.92□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 39.1
RPS3P23396 BUD31-209ENST00000496696 585 ntTSL 24.16□□□□□ -1.745e-7■■■■■ 39.1
RPS3P23396 BUD31-207ENST00000471813 341 ntTSL 22.02□□□□□ -2.095e-7■■■■■ 39.1
RPS3P23396 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 56.98□□□□□ -1.298e-13■■■■■ 39.1
RPS3P23396 HYOU1-201ENST00000526354 568 ntTSL 220.46■□□□□ 0.871e-11■■■■■ 39
RPS3P23396 HYOU1-216ENST00000610597 491 ntTSL 414.71□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 39
RPS3P23396 CHCHD2-202ENST00000473095 694 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.393e-11■■■■■ 38.9
RPS3P23396 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 38.9
RPS3P23396 PGD-206ENST00000487775 462 ntTSL 213.36□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 38.9
RPS3P23396 APEH-213ENST00000480772 703 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 38.9
RPS3P23396 NDUFB5-203ENST00000468210 824 ntTSL 214.09□□□□□ -0.158e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 NDUFB5-202ENST00000359944 1054 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.188e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.198e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 NDUFB5-205ENST00000472629 744 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.578e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 NDUFB5-209ENST00000480374 729 ntTSL 311.33□□□□□ -0.68e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 NDUFB5-210ENST00000482604 671 ntTSL 511.31□□□□□ -0.68e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 NDUFB5-201ENST00000259037 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.718e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.978e-9■■■■■ 38.8
RPS3P23396 POM121L2-201ENST00000429945 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 34.17□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 38.8
RPS3P23396 TSPAN7-204ENST00000471410 1210 ntTSL 212.12□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 38.8
RPS3P23396 TSPAN7-205ENST00000475216 1224 ntTSL 211.46□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 38.8
RPS3P23396 TSPAN7-201ENST00000286824 1270 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 38.8
RPS3P23396 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 38.8
RPS3P23396 TSPAN7-203ENST00000419600 1683 ntTSL 26.8□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 38.8
RPS3P23396 GRN-215ENST00000589536 546 ntTSL 323.53■■□□□ 1.364e-8■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 GRN-207ENST00000587109 535 ntTSL 215.38■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 38.8
RPS3P23396 GRN-219ENST00000592323 550 ntTSL 415.34■□□□□ 0.054e-8■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-208ENST00000529905 1836 ntTSL 514.77□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 GRN-212ENST00000588170 588 ntTSL 214.75□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-218ENST00000641924 550 nt14.61□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 GRN-210ENST00000587958 560 ntTSL 214.48□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-212ENST00000641236 2481 nt14.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.71□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-217ENST00000641691 2253 nt13.38□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-210ENST00000530704 2340 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-211ENST00000641083 2353 nt11.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 38.8
RPS3P23396 SLC16A1-206ENST00000481750 430 ntTSL 21.55□□□□□ -2.164e-10■■■■■ 38.8
RPS3P23396 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 413.22□□□□□ -0.298e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.318e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.418e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.448e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.138e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 24.62□□□□□ -1.678e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 FLVCR2-205ENST00000554496 441 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 FLVCR2-209ENST00000555385 218 ntTSL 49.38□□□□□ -0.911e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.971e-20■■■■■ 38.7
RPS3P23396 HEXA-214ENST00000569116 449 ntTSL 212.37□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 38.7
RPS3P23396 ATP5G2-207ENST00000552120 511 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.159e-9■■■■■ 38.6
RPS3P23396 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 RNF128-203ENST00000418562 839 ntTSL 53.54□□□□□ -1.843e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.13e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-206ENST00000506516 473 ntTSL 1 (best)7.09□□□□□ -1.271e-8■■■■■ 38.6
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RPS3P23396 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-205ENST00000505583 583 ntTSL 1 (best)5.54□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-215ENST00000513677 221 ntTSL 1 (best)5.38□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-208ENST00000507009 388 ntTSL 1 (best)5.38□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.661e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-212ENST00000511198 444 ntTSL 1 (best)4.49□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-214ENST00000513557 277 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.971e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-211ENST00000510196 508 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.971e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-203ENST00000503255 486 ntTSL 1 (best)1.57□□□□□ -2.161e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.251e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.251e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 GYPB-207ENST00000506679 606 ntTSL 1 (best)0.46□□□□□ -2.341e-8■■■■■ 38.6
RPS3P23396 SCARB2-222ENST00000640634 1734 ntTSL 510.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 38.5
RPS3P23396 SCARB2-218ENST00000639715 4355 ntTSL 55.6□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 38.5
RPS3P23396 UROD-206ENST00000461035 486 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 38.4
RPS3P23396 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.11e-323■■■■■ 38.4
RPS3P23396 EIF4A3-206ENST00000575978 3593 ntTSL 28□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 38.4
RPS3P23396 COPE-210ENST00000600528 261 ntTSL 38.96□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 38.4
RPS3P23396 TKFC-206ENST00000525366 916 ntTSL 218.18■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 38.4
RPS3P23396 NANS-206ENST00000495319 764 ntTSL 317.73■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 38.3
RPS3P23396 HSPB1-203ENST00000447574 1455 ntTSL 1 (best)19.81■□□□□ 0.768e-9■■■■■ 38.3
RPS3P23396 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 38.3
RPS3P23396 LPCAT3-204ENST00000536797 1412 ntTSL 220.53■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 38.1
RPS3P23396 LPCAT3-211ENST00000543794 1099 ntTSL 218.92■□□□□ 0.626e-7■■■■■ 38.1
RPS3P23396 LPCAT3-210ENST00000540090 974 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.626e-7■■■■■ 38.1
RPS3P23396 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.537e-20■■■■■ 38
RPS3P23396 TSEN34-206ENST00000456872 853 ntTSL 224.29■■□□□ 1.482e-10■■■■■ 38
RPS3P23396 TSEN34-205ENST00000455798 956 ntTSL 224.19■■□□□ 1.462e-10■■■■■ 38
RPS3P23396 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.257e-20■■■■■ 38
RPS3P23396 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 38
RPS3P23396 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.017e-20■■■■■ 38
RPS3P23396 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.047e-20■■■■■ 38
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