Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKMT2P17540 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKMT2P17540 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms