Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEACAM1P13688 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEACAM1P13688 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CEACAM1P13688 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEACAM1P13688 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms