Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA4P13612 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA4P13612 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA4P13612 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms