Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRFP11831 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRFP11831 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRFP11831 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRFP11831 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRFP11831 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRFP11831 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRFP11831 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRFP11831 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRFP11831 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRFP11831 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRFP11831 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRFP11831 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRFP11831 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRFP11831 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRFP11831 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRFP11831 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRFP11831 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRFP11831 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRFP11831 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRFP11831 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRFP11831 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRFP11831 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRFP11831 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRFP11831 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRFP11831 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRFP11831 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRFP11831 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRFP11831 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRFP11831 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRFP11831 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRFP11831 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRFP11831 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRFP11831 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRFP11831 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRFP11831 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRFP11831 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRFP11831 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRFP11831 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRFP11831 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRFP11831 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRFP11831 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRFP11831 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRFP11831 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRFP11831 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRFP11831 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRFP11831 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRFP11831 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRFP11831 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRFP11831 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRFP11831 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRFP11831 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRFP11831 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRFP11831 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRFP11831 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRFP11831 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms