Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDN1P05305 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDN1P05305 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDN1P05305 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EDN1P05305 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDN1P05305 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDN1P05305 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EDN1P05305 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDN1P05305 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDN1P05305 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EDN1P05305 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EDN1P05305 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EDN1P05305 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EDN1P05305 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EDN1P05305 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDN1P05305 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EDN1P05305 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDN1P05305 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDN1P05305 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDN1P05305 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDN1P05305 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDN1P05305 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EDN1P05305 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDN1P05305 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDN1P05305 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDN1P05305 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EDN1P05305 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EDN1P05305 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDN1P05305 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDN1P05305 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDN1P05305 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDN1P05305 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EDN1P05305 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EDN1P05305 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDN1P05305 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDN1P05305 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EDN1P05305 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDN1P05305 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDN1P05305 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDN1P05305 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDN1P05305 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDN1P05305 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EDN1P05305 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDN1P05305 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EDN1P05305 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDN1P05305 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EDN1P05305 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDN1P05305 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDN1P05305 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDN1P05305 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDN1P05305 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDN1P05305 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDN1P05305 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDN1P05305 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDN1P05305 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDN1P05305 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EDN1P05305 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDN1P05305 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDN1P05305 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDN1P05305 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDN1P05305 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDN1P05305 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDN1P05305 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDN1P05305 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDN1P05305 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDN1P05305 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDN1P05305 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms