Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHBGP04278 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHBGP04278 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHBGP04278 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHBGP04278 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHBGP04278 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHBGP04278 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHBGP04278 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHBGP04278 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHBGP04278 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHBGP04278 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHBGP04278 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHBGP04278 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHBGP04278 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHBGP04278 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHBGP04278 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHBGP04278 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHBGP04278 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHBGP04278 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHBGP04278 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHBGP04278 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHBGP04278 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHBGP04278 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHBGP04278 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHBGP04278 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHBGP04278 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHBGP04278 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHBGP04278 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHBGP04278 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHBGP04278 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHBGP04278 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHBGP04278 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHBGP04278 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHBGP04278 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHBGP04278 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHBGP04278 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHBGP04278 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHBGP04278 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHBGP04278 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHBGP04278 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHBGP04278 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHBGP04278 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHBGP04278 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms