Protein–RNA interactions for Protein: P01127

PDGFB, Platelet-derived growth factor subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFBP01127 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFBP01127 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFBP01127 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFBP01127 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFBP01127 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFBP01127 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDGFBP01127 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDGFBP01127 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFBP01127 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFBP01127 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFBP01127 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms