Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EGFRP00533 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
EGFRP00533 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
EGFRP00533 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EGFRP00533 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EGFRP00533 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EGFRP00533 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EGFRP00533 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EGFRP00533 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EGFRP00533 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EGFRP00533 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EGFRP00533 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EGFRP00533 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EGFRP00533 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EGFRP00533 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EGFRP00533 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EGFRP00533 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EGFRP00533 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EGFRP00533 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EGFRP00533 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EGFRP00533 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EGFRP00533 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EGFRP00533 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EGFRP00533 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EGFRP00533 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EGFRP00533 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EGFRP00533 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EGFRP00533 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EGFRP00533 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EGFRP00533 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EGFRP00533 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EGFRP00533 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EGFRP00533 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EGFRP00533 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EGFRP00533 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EGFRP00533 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EGFRP00533 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EGFRP00533 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EGFRP00533 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
EGFRP00533 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EGFRP00533 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EGFRP00533 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EGFRP00533 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EGFRP00533 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EGFRP00533 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EGFRP00533 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EGFRP00533 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EGFRP00533 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EGFRP00533 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EGFRP00533 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EGFRP00533 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EGFRP00533 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EGFRP00533 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EGFRP00533 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EGFRP00533 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EGFRP00533 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EGFRP00533 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EGFRP00533 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EGFRP00533 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EGFRP00533 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EGFRP00533 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EGFRP00533 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EGFRP00533 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms