Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBF1O95248 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBF1O95248 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBF1O95248 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBF1O95248 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBF1O95248 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBF1O95248 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBF1O95248 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBF1O95248 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBF1O95248 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBF1O95248 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBF1O95248 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBF1O95248 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBF1O95248 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SBF1O95248 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBF1O95248 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBF1O95248 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBF1O95248 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBF1O95248 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBF1O95248 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SBF1O95248 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SBF1O95248 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SBF1O95248 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SBF1O95248 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBF1O95248 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBF1O95248 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBF1O95248 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBF1O95248 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBF1O95248 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBF1O95248 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBF1O95248 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBF1O95248 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBF1O95248 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBF1O95248 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBF1O95248 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBF1O95248 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBF1O95248 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBF1O95248 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBF1O95248 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBF1O95248 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SBF1O95248 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBF1O95248 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBF1O95248 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SBF1O95248 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SBF1O95248 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SBF1O95248 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SBF1O95248 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBF1O95248 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBF1O95248 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBF1O95248 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBF1O95248 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBF1O95248 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBF1O95248 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBF1O95248 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBF1O95248 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBF1O95248 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SBF1O95248 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBF1O95248 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBF1O95248 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBF1O95248 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBF1O95248 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBF1O95248 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBF1O95248 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBF1O95248 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SBF1O95248 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBF1O95248 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SBF1O95248 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SBF1O95248 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SBF1O95248 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SBF1O95248 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SBF1O95248 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBF1O95248 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBF1O95248 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBF1O95248 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBF1O95248 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBF1O95248 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SBF1O95248 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBF1O95248 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBF1O95248 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBF1O95248 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SBF1O95248 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBF1O95248 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBF1O95248 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBF1O95248 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBF1O95248 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SBF1O95248 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBF1O95248 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBF1O95248 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBF1O95248 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBF1O95248 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SBF1O95248 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBF1O95248 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SBF1O95248 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SBF1O95248 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SBF1O95248 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SBF1O95248 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SBF1O95248 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SBF1O95248 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SBF1O95248 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SBF1O95248 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms