Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAMTA2O94983 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAMTA2O94983 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAMTA2O94983 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAMTA2O94983 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms