Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF21O75509 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF21O75509 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms