Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC22BO75396 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22BO75396 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22BO75396 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms