Protein–RNA interactions for Protein: O75351

VPS4B, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4BO75351 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS4BO75351 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS4BO75351 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms