Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNASEH1O60930 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNASEH1O60930 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNASEH1O60930 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms