Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAB2O43741 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKAB2O43741 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRKAB2O43741 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKAB2O43741 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms