Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSI1O43347 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSI1O43347 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSI1O43347 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSI1O43347 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSI1O43347 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSI1O43347 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSI1O43347 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSI1O43347 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSI1O43347 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSI1O43347 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSI1O43347 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSI1O43347 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSI1O43347 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSI1O43347 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSI1O43347 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSI1O43347 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSI1O43347 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI1O43347 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI1O43347 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI1O43347 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI1O43347 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI1O43347 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI1O43347 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSI1O43347 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSI1O43347 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSI1O43347 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSI1O43347 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSI1O43347 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSI1O43347 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSI1O43347 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSI1O43347 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI1O43347 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI1O43347 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI1O43347 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI1O43347 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI1O43347 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI1O43347 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MSI1O43347 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI1O43347 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI1O43347 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI1O43347 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSI1O43347 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSI1O43347 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSI1O43347 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSI1O43347 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSI1O43347 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSI1O43347 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSI1O43347 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSI1O43347 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSI1O43347 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSI1O43347 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSI1O43347 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSI1O43347 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSI1O43347 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSI1O43347 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSI1O43347 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms