Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VGFO15240 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VGFO15240 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VGFO15240 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VGFO15240 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VGFO15240 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VGFO15240 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VGFO15240 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VGFO15240 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VGFO15240 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VGFO15240 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VGFO15240 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VGFO15240 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VGFO15240 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VGFO15240 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VGFO15240 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VGFO15240 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VGFO15240 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VGFO15240 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
VGFO15240 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
VGFO15240 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
VGFO15240 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VGFO15240 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
VGFO15240 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
VGFO15240 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
VGFO15240 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
VGFO15240 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
VGFO15240 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VGFO15240 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
VGFO15240 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
VGFO15240 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
VGFO15240 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
VGFO15240 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
VGFO15240 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
VGFO15240 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.8■■■■□ 3
VGFO15240 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
VGFO15240 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
VGFO15240 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
VGFO15240 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
VGFO15240 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
VGFO15240 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VGFO15240 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
VGFO15240 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.78■■■■□ 3
VGFO15240 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VGFO15240 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VGFO15240 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
VGFO15240 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VGFO15240 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VGFO15240 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VGFO15240 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VGFO15240 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
VGFO15240 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGFO15240 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGFO15240 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGFO15240 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGFO15240 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGFO15240 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGFO15240 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VGFO15240 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
VGFO15240 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
VGFO15240 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
VGFO15240 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
VGFO15240 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VGFO15240 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VGFO15240 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
VGFO15240 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VGFO15240 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms