Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPEF2O14830 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPEF2O14830 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPEF2O14830 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPEF2O14830 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms