Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MEIS1O00470 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS1O00470 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS1O00470 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms