Protein–RNA interactions for Protein: H7C1Q1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1Q1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C1Q1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C1Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C1Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C1Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
H7C1Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H7C1Q1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H7C1Q1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H7C1Q1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
H7C1Q1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H7C1Q1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H7C1Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H7C1Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H7C1Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H7C1Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H7C1Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H7C1Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H7C1Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H7C1Q1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H7C1Q1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H7C1Q1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H7C1Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1Q1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1Q1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1Q1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H7C1Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H7C1Q1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H7C1Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H7C1Q1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H7C1Q1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H7C1Q1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H7C1Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H7C1Q1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H7C1Q1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H7C1Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H7C1Q1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H7C1Q1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H7C1Q1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H7C1Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H7C1Q1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H7C1Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms