Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NPIPB6E9PJ23 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms