Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLTPD2A6NH11 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GLTPD2A6NH11 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GLTPD2A6NH11 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLTPD2A6NH11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms