Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAF2A6NFQ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCAF2A6NFQ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCAF2A6NFQ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms