Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LNP1A1A4G5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LNP1A1A4G5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LNP1A1A4G5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms