Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCRBV7S3A2A0A539 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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TCRBV7S3A2A0A539 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCRBV7S3A2A0A539 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCRBV7S3A2A0A539 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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