Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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