Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1Q9UJ41 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RABGEF1Q9UJ41 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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