Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFHD1Q9BUP0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms