Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PERM1Q5SV97 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms