Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL38Q2WGJ6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms