Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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