Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UBE2V1Q13404 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms