Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms