Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms